Шалва Маглакелидзе родился 2 мая 1893 года в селе Дихашхо в семье зажиточного крестьянина. Получив образование в Кутаисской гимназии, он поступил на юридический факультет Московского университета, но учебу прервала Первая мировая война.
В 1919 году он был назначен генерал-губернатором Борчалинского края, а в 1921 году возглавил оборону Абхазии, противясь приходу большевиков. После падения независимой Грузии он скрывался, но в 1921 году был арестован.
После освобождения Маглакелидзе бежал в Латвию, затем в Чехословакию, где получил степень доктора права. В 1930-х он перебрался в Германию, где включился в деятельность грузинской эмиграции.
С началом Великой Отчесетвенной войны он стал одним из лидеров Грузинского легиона вермахта — военного формирования, созданного из грузинских эмигрантов и военнопленных для борьбы против СССР. В 1943 году он получил звание генерал-майора вермахта и возглавил Кавказский комитет в структурах коллаборационистского «Комитета освобождения народов России» генерала Власова.
После поражения нацистской Германии Маглакелидзе, понимая, что его ждет суровая расплата за сотрудничество с врагом, бежал в Италию, где скрывался под чужим именем. В 1950 году он перебрался в ФРГ, где, пользуясь покровительством западногерманских властей, устроился советником при канцлере Конраде Аденауэре. Но даже после краха Третьего рейха Маглакелидзе не оставил антисоветской деятельности. 26 января 1954 года он вместе с сыном Гаиозом создал в Мюнхене «Союз грузинских воинов в изгнании» — организацию, объединявшую бывших легионеров-коллаборационистов и грузинских эмигрантов, мечтавших о реванше.
В 1954 году советскими спецами была проведена блестящая операция по задержанию нацистского преступника: сначала чекисты похитили его жену и дочь, перехватив их при перелете из Пакистана. Затем, 1 августа 1954 года, был схвачен и сам Маглакелидзе — его вывезли в Восточную Германию, а оттуда тайно доставили в СССР. На допросах он быстро признал свои ошибки, назвав деятелей грузинской эмиграции агентами США и Великобритании.
Первоначально содержавшийся под домашним арестом с денежным довольствием, Маглакелидзе в 1962 году получил юридическое образование и начал работать адвокатом. Столь мягкое обращение с бывшим нацистским преступником позволяет предположить, что он предоставил советским спецслужбам ценную информацию о деятельности грузинской эмиграции и западных разведок.
